Jupyter-Notebookのインストール(CentOS7)

CentOS7にAnacondaをインストールして、Anaconda経由でpython環境をインストールしながら、Jupyter-Notebookの環境を作成してきます。
前提条件として、CentOS7がインストールされていることが必要です。
https://mizunolab.sist.ac.jp/2020/04/1-virtualboxcentos7.html
必須ではありませんが、下記を実施後の方がわかりやすいかもしれません。
https://mizunolab.sist.ac.jp/2020/04/centos7lamp.html

また以前にUbuntu16.04にインストール方法を書いていますので参考にしてください。ただし、リンクや利用するバージョンが変わっています。最後のRのインストールも変わっています。
https://mizunolab.sist.ac.jp/2019/01/pythonranacondajupyter-notebook.html

(1) Anacondaのインストール
wgetを使える環境を整えます

[root@localhost ~]# yum install wget

次にAnaconda(522MB)のダウンロードをします。

[root@localhost ~]# wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh

Anacondaのインストール

[root@localhost ~]# bash Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh 

Enterを押して開始する

ライセンスに同意(yes)

インストール場所はそのまま(何も入力しない)

Anacondaのパス設定を利用する(yes)

インストールが完了

インストール後、condaコマンドが使えるか確認します。

ホームディレクトリで、「.bashrc」があるか確認します。

[root@localhost ~]# ls -la

この.bashrcを再読み込みして環境変数を反映させます。

[root@localhost ~]# source .bashrc

condaコマンドでインストールされているバージョンを表示します。

(base) [root@localhost ~]# conda -V

これでパスが反映されました。

(2) Jupyter-Notebookの設定

これは、

https://mizunolab.sist.ac.jp/2019/01/pythonranacondajupyter-notebook.html

の「(2) jupyter-notebookの設定」　と同様の設定をしますので、このリンクをみてください。ただし、今回の実習ではアクセスするパスワードを「CentOS7」とします。

[注意]

今回は実習として「root」で行っています。この場合だけ、jupyter-notebookを起動する場合に、rootユーザでの起動を許可するオプションが必要です。

(base) [root@localhost ~]# jupyter-notebook --allow-root

(3) HelloJupyterを作成

これも

https://mizunolab.sist.ac.jp/2019/01/pythonranacondajupyter-notebook.html

の「(3)HelloJupyterを作成」をみて実施してください

(4) Rの導入

これは前のリンクのものとは内容が変わっています。

jupyter-notebookを一旦終了して、次のコマンドでRをインストールします。

(base) [root@localhost ~]# conda install -c r r-irkernel

もう一度、jupyter-notebookを立ち上げます。

(base) [root@localhost ~]# jupyter-notebook --allow-root

サイトにアクセスして、ファイルを作る「New」をクリックすると「R」の選択肢が出てきます。Rでファイルを作成します。

ファイル名は「HelloJupyterR」とします。

Rのコードを入れて実行してみます。

ここまでできれば、Jupyter-NotebookでのPythonとRの環境設定は終了です。